Aurore Lamy : Ingénieure de recherche en bio-informatique

Ingénieure de recherche en bio-informatique à l’IRSEA, Aurore collabore avec les chercheur·euses et chefs de département pour mener des travaux en recherche fondamentale et appliquée. Elle analyse les séquences protéiques, modélise et simule les interactions des sémiochimiques, et participe à la rédaction de résultats et à la veille scientifique. Passionnée par la modélisation et les simulations, elle aime comprendre le fonctionnement des sémiochimiques au niveau moléculaire et contribuer à des applications concrètes de ses recherches.

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Quelles sont tes principales missions ?

En tant qu’ingénieure de recherche en bio-informatique, je travaille en collaboration avec les chercheurs des différents départements mais aussi en collaboration avec Rajesh Durairaj chef du département de Bio-informatique et Communication Chimique. Je peux également être référente sur certains projets de recherche.

Je travaille sur deux domaines distincts en bio-informatique. D’un côté de la recherche fondamentale ce qui comprend de l’analyse de séquences protéiques, de la modélisation et des simulations. Grâce à notre logiciel, je peux assembler une protéine avec des molécules, très souvent des sémiochimiques. J’analyse ensuite comment elles interagissent ensemble.

Le but de ces recherches est de comprendre chaque jour un peu plus, le mode de fonctionnement des sémiochimiques d’un point de vue moléculaire.

Ces simulations s’opèrent grâce à un terminal de commande Linux et des commandes particulières.

Pour le deuxième domaine il s’agit cette fois-ci de recherche appliquée. C’est-à-dire que mes recherches peuvent nous permettre ensuite de déposer un brevet et de développer, dans un second temps, un produit.

 Il s’agit ici d’études pharmacophores, qui ont pour but de trouver une alternative à certains sémiochimiques, 

Comme beaucoup d’autres ingénieurs, j’ai une partie de mon travail dédiée à une mission bibliographique afin de me tenir au courant des différentes avancées dans le domaine de la bio-informatique.

Enfin, il y a la partie rédactionnelle qui met en avant les différents résultats observés durant mes recherches.

 

Comment se déroule une journée type ?

Généralement je lance les simulations dès le matin car cela prend en moyenne 7h. Ensuite je peux traiter les projets pharmacophores ou bien me pencher sur des projets de modélisation, le rythme dépend des avancées des projets.

 

Que préfères-tu dans ton travail ?

Je préfère la simulation et la modélisation car j’aime la recherche fondamentale et j’aime comprendre comment les sémiochimiques fonctionnent et agissent au sein du corps, d’un point de vue moléculaire.

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30 Irsea - naissance de l'Institut
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30 ans de recherche et d’innovation

Depuis 1995, l’IRSEA explore les langages invisibles du vivant. Fondé à Apt par le Dr Patrick Pageat, l’Institut est devenu un centre de recherche pionnier en sémiochimie et éthologie appliquée, avec plus de 40 collaborateur·rices et 400 brevets. Un institut de référence sur la communication chimique entre les espèces, pionnier et engagé pour une science éthique, innovante et utile, au service du vivant.

INSIDE IRSEA

Alessandro Cozzi : Directeur général

Directeur général et directeur recherche et enseignement de l’IRSEA, il supervise les équipes et les projets, entre science et gestion. Passionné par la recherche fondamentale et appliquée, il aime voir naître et évoluer les idées. Son rôle consiste aussi à accompagner les personnes et à bâtir un cadre pour faire grandir l’Institut. Inscrivant l’IRSEA dans une démarche One Health, il s’appuie sur une expertise pluridisciplinaire et le biomimétisme pour développer des solutions utiles au bien-être animal, à la santé animale et humaine.

INSIDE IRSEA

Ennia Bracco : Technicienne de recherche

Technicienne de recherche à l’IRSEA, elle réalise des analyses de matrices animales, végétales ou insectes pour identifier des molécules messagères chimiques. Elle collabore avec les chercheur·euses et ingénieur·es pour apporter des réponses concrètes aux projets scientifiques, retraitant et interprétant les données, rédigeant des rapports et assurant la gestion des déchets chimiques. Passionnée par l’exploration de l’inconnu, elle aime investiguer et se remettre en question chaque jour pour faire avancer la recherche.

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Ingénieure de recherche en bio-informatique à l’IRSEA, Aurore collabore avec les chercheur·euses et chefs de département pour mener des travaux en recherche fondamentale et appliquée. Elle analyse les séquences protéiques, modélise et simule les interactions des sémiochimiques, et participe à la rédaction de résultats et à la veille scientifique. Passionnée par la modélisation et les simulations, elle aime comprendre le fonctionnement des sémiochimiques au niveau moléculaire et contribuer à des applications concrètes de ses recherches.